La première pièce de Stéphane Guérin, Le Premier de nous deux, est mise en scène par Françoise Petit au Théâtre du Renard à Paris en 2001. Il écrit pour le metteur en scène Franck Berthier Je retiens tout ce que j’oublie, créé sur la Scène nationale Bonlieu (Annecy) en 2009, puis une libre adaptation d’Ubu roi, reprise au Vingtième Théâtre en 2010. En 2011, Médée, la folle est mise en scène par Laurent Gutmann et Ma vie est un snuff-movie mis en voix au Théâtre du Peuple à Bussang. Kalashnikov est créé au Centre dramatique national de Montpellier et au Théâtre du Rond-Point dans une mise en scène de Pierre Notte. La pièce est lauréate du prix théâtre 2012 de la Fondation Barrière. Caligula TM est créé en 2013 à Lille et représenté sur la Scène nationale La Rose des vents à Villeneuve-d’Ascq dans une mise en scène de Violaine Debarge. Neuf est mis en scène par Manex Fuchs et Georges Bigot en 2014 sur la Scène nationale du Sud-Aquitain (Bayonne), en tournée pendant trois ans et repris en 2017 au Théâtre 13. Jean-Paul Muel met en scène Les Grandes Filles au Théâtre Montparnasse en 2015. Surtout ne regardez pas mon jardin est mis en scène par Violaine Debarge à Villeneuve-d’Ascq en 2017 puis en tournée. Sa pièce Kamikazes est lauréate de la Commission nationale d’aide à la création de textes dramatiques – Artcena. Elle est créée au Théâtre Buffon à Avignon en 2018 dans une mise en scène d’Anne Bouvier.
Stéphane Guérin a reçu une bourse d’écriture du Centre national du cinéma pour le scénario de Marie, Nonna, la Vierge et moi, un long métrage de Francis Renaud. Il reçoit en 2004 le soutien de l’association Beaumarchais pour sa pièce Messe basse. Il est boursier du Centre national du livre pour son projet Tu t’en vas tout le temps.